El objetivo de la seguridad de los buques e instalaciones portuarias consiste en establecer un entorno en el cual el comercio pueda realizarse con garantías razonables, de tal manera que no será entorpecido por la actividad delictiva, ni se transforme en un conducto para esa actividad.

Los Planes de Seguridad Portuaria, deben cumplir con limitar las oportunidades de cometer delitos en el sistema de transporte fluvial y marítimo, sus proveedores y usuarios.

En la elaboración de un programa de seguridad debe ponerse el acento en la disuasión, prevención, detección y reducción de pérdidas atribuidas a actividades delictivas. Para ello, las operaciones de seguridad portuaria deben ser más proactivas que meramente reactivas.

La seguridad portuaria también debe permitir evaluar las amenazas contra el buque y el puerto y reaccionar adecuadamente ante ellas, adoptando para ello diferentes modos de acción entre los que podemos mencionar: Elaboración de Planes de seguridad, fomentar la conciencia a través de la capacitación y practicar simulacros. El objetivo debe ser identificar los procesos y procedimientos que pueden implementarse en la adaptación a un entorno cambiante.